Printre cele mai mari provocari in educatia copiilor cu nevoi speciale se numara: adaptarea programelor si metodologiei la nevoile specifice ale fiecarui copil, asigurarea resurselor umane si materiale adecvate, implicarea parintilor si a comunitatii in procesul educational, precum si combaterea discriminarii si a stigmatizarii pe care acesti copii le pot intampina.