Moleculele organice se clasifică în funcție de structura lor pe alifatice și aromatice. Moleculele alifatice sunt cele care conțin lanțuri de atomi de carbon care pot fi deschise sau închise și pot fi saturate sau nesaturate. Moleculele aromatice conțin un nucleu aromatic inelar format din atomi de carbon și hidrogen. Aceste molecule sunt caracterizate de un sistem de legături duble conjugate care conferă moleculei o stabilitate crescută și proprietăți speciale.