Utilizarea clonelor in agricultura poate avea un impact negativ asupra biodiversitatii si asupra cultivarii culturilor agricole, prin pierderea diversitatii genetice si cresterea vulnerabilitatii la boli si la schimbarile climatice. In plus, clonarea poate duce la pierderea caracteristicilor de adaptare la mediu si a productivitatii in timp, datorita gradului ridicat de uniformitate genetica.