Practicarea agriculturii intensive poate duce la epuizarea solului și, prin urmare, la pierderea fertilității acestuia în timp, în special prin utilizarea excesivă a îngrășămintelor chimice și pesticidelor. Acest lucru poate duce la diminuarea cantității și calității recoltelor, precum și la poluarea solului și apelor subterane. Agricultura intensivă poate, de asemenea, afecta solul prin compactarea solului și erodarea solului ca urmare a utilizării excesive a utilajelor.