Moleculele de proteine sunt clasificate în funcție de structura lor primară, secundară, terțiară și cvaternară. Structura primară reprezintă secvența de aminoacizi în lungul lanțului proteic, în timp ce structura secundară definește aranjamentul local al aminoacizilor în α-helix sau β-sheet-uri. Structura terțiară se referă la aranjamentul moleculelor de proteine la nivelul întregii molecule, în timp ce structura cvaternară descrie modul în care mai multe molecule de proteine interacționează între ele.