Celulele T ale sistemului imunitar pot fi responsabile de apariția autoimunității prin activarea și agresiunea împotriva țesuturilor proprii ale organismului. Acest lucru se datorează adesea unei erori a sistemului imunitar, care identifică propriile țesuturi ca fiind agenți străini și încearcă să-i elimine prin orice mijloace posibile.