Una din cele mai mari provocări este finanțarea redusă pentru instituțiile de învățământ, care duce la lipsa resurselor necesare pentru cercetare și dezvoltare. De asemenea, numărul redus de programe de studiu în limba engleză limitează atractivitatea universităților românești pentru studenții internaționali, iar birocrația excesivă poate împiedica inovația și flexibilitatea în învățământ.