Aminoacizii sunt clasificați în funcție de gruparea lor funcțională în aminoacizi cu lanț lateral alifatic, care conțin grupări alchil (cum ar fi glicina, alanina și valina); aminoacizi cu lanț lateral aromatic, care conțin grupări fenil (cum ar fi tirosina și fenilalanina); aminoacizi cu lanț lateral sulfurat, care conțin grupări tiol (cum ar fi cisteina și metionina); aminoacizi cu lanț lateral bazic, care conțin grupări amoniu (cum ar fi lizina, arginina și histidina); și aminoacizi cu lanț lateral acid, care conțin grupări carboxil (cum ar fi acidul aspartic și acidul glutamic).