Cele mai mari obstacole în calea dezvoltării agriculturii ecologice în România includ lipsa încrederii în produsele ecologice, birocrația și neajunsurile legislative, precum și costurile ridicate de obținere a certificărilor ecologice și de comercializare a produselor. De asemenea, există o cultură limitată în ceea ce privește protecția mediului și mulți fermieri nu sunt încă convinși de beneficiile aduse de respectarea regulilor agriculturii ecologice.