Diferite studii au arătat că meditația poate influența diferite părți ale creierului, cum ar fi cortexul prefrontal, amigdala sau hipocampul. De exemplu, practicarea regulată a meditației poate duce la creșterea densității materiei cenușii în cortexul prefrontal, zonele responsabile pentru atenția și luarea deciziilor. În plus, meditația poate reduce activitatea amigdalei, care este asociată cu stresul și anxietatea, și poate crește activitatea hipocampului, care joacă un rol important în învățare și memorare.